近日,中國農業(yè)科學院植物保護研究所教授周雪平團隊與北京市農林科學院研究員李少芳團隊聯(lián)合在《科學通報》(Science Bulletin)在線發(fā)表研究論文。研究綜合運用三種原理不同的m?A檢測方法,揭示了侵染西瓜的兩種細胞質復制型RNA病毒——瓜蔞斑駁花葉病毒(TrMMV)和西葫蘆黃花葉病毒(ZYMV)的RNA中缺乏N?-甲基腺苷(m?A)修飾,為植物病毒表觀轉錄組學研究提供了新見解。
N?-甲基腺苷(m?A)是真核生物mRNA中最常見的內部修飾,發(fā)生于腺苷酸第六位氮原子上,在基因表達調控中發(fā)揮重要作用。該修飾主要由定位于細胞核的甲基轉移酶復合物(MTC)催化完成。盡管m?A表觀轉錄組測序技術顯著推動了該領域的研究,但容易產生的假信號可能導致一些錯誤結果。
研究聚焦侵染西瓜的兩種細胞質復制型病毒TrMMV與ZYMV。研究結果顯示,這兩種病毒RNA不含m?A修飾。
該研究揭示,細胞質復制型植物RNA病毒中,m?A修飾可能并非普遍存在。該結果不僅凸顯了在病毒及寄主內源RNA表觀修飾研究中設置嚴格陰性對照的關鍵作用,也為未來相關研究提供了降低假陽性、實現(xiàn)無偏倚檢測的重要方法學策略。
植保所博士生潘福安、博士后荊嘉賢為論文共同第一作者,周雪平和李少芳為共同通訊作者。該研究得到了國家重點研發(fā)計劃、北京市蔬菜研究中心創(chuàng)新發(fā)展項目及高層次人才啟動基金支持。
相關論文信息:https://doi.org/10.1016/j.scib.2025.07.019