中國農科院作物科學研究所特色農作物優異種質資源發掘與創新利用團隊,聯合國內外6家科研機構,對來自19個國家的683份普通菜豆資源的全基因組進行重測序,并開展了歷時三年的主要農藝性狀表型鑒定,明確了菜豆種質資源的遺傳多樣性和群體結構特點,為培育高產與抗病的菜豆提供了寶貴的遺傳資源。相關研究成果24日零時以長文在線發表于《自然·遺傳學(Nature Genetics)》。
團隊學者、中國農科院作科所研究員王述民介紹,“普通菜豆”之名源于拉丁文的Phaseolus vulgaris,是指原產中美洲、嫩莢供蔬食、在世界上廣為栽培的菜豆屬作物,品種繁雜;在我國,因食用部位的不同而分為兩大類:以食用籽粒為主的蕓豆或干菜豆,以食用嫩莢為主的四季豆。本項目的研究主體是以食用籽粒作糧食用途的普通菜豆。他表示,菜豆具有高蛋白、中淀粉、低脂肪、營養元素豐富等特點,是人類十分重要的植物蛋白質來源。我國是世界菜豆主產國之一,但由于對其種質資源的遺傳研究起步較晚,對現有種質資源鑒定不夠,導致其遺傳本底不清,難以被育種家有效利用。
研究人員在對6500余份種質資源表型分析的基礎上,篩選國內外683份菜豆種質資源核心樣品開展了全基因組重測序,發掘480多萬個單核苷酸多態性(SNP),構建出國際首張精細的菜豆單倍型圖譜;在緯度跨度、光照時間長短差異明顯的四地(黑龍江哈爾濱、河南南陽、貴州畢節和海南三亞)完成了表型鑒定,采用全基因組關聯分析,鑒定出了505個與其產量、花期、籽粒特性、抗病性等主要農藝性狀緊密相關的遺傳位點,為菜豆的基因發掘和遺傳改良研究提供了海量的表型數據和基因型數據,有望大幅提升普通菜豆育種水平;同時發現與籽粒性狀和生育期等性狀相關位點位于人工改良馴化區間,成功揭示了人工選擇對基因組的影響。