科技日?qǐng)?bào)北京10月12日電 (記者瞿劍)中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉所研究員、深圳農(nóng)業(yè)基因組所副所長(zhǎng)黃三文領(lǐng)導(dǎo)的國(guó)際番茄變異組研究團(tuán)隊(duì),通過(guò)對(duì)世界各地的360份番茄種質(zhì)進(jìn)行重測(cè)序分析,構(gòu)建了完整的番茄遺傳變異組圖譜,揭示了番茄的進(jìn)化歷史,并為番茄的基因挖掘和分子育種奠定了基礎(chǔ)。其最新研究成果于北京時(shí)間13日凌晨1時(shí)以長(zhǎng)篇論文在線發(fā)表于《自然·遺傳學(xué)》(Nature Genetics)雜志。
黃三文介紹,今天我們食用的栽培番茄是由野生番茄馴化而來(lái),在長(zhǎng)期馴化過(guò)程中,其果實(shí)在重量、顏色、形狀等方面發(fā)生了顯著變化:野生番茄果實(shí)非常小,重量?jī)H1-2克;而現(xiàn)代栽培番茄的果重是其祖先的100多倍。
通過(guò)群體遺傳學(xué)分析,該研究揭示了番茄果實(shí)變大經(jīng)歷了從醋栗番茄到櫻桃番茄再到大果栽培番茄的兩次進(jìn)化過(guò)程,在此過(guò)程中分別有5個(gè)和13個(gè)果實(shí)重量基因受到了人類的定向選擇。
研究團(tuán)隊(duì)通過(guò)比較不同番茄群體的基因組差異,發(fā)現(xiàn)第5號(hào)染色體是決定鮮食番茄和加工番茄(主要用于生產(chǎn)番茄醬)差異的主要基因組區(qū)域。通過(guò)全基因組關(guān)聯(lián)分析,發(fā)現(xiàn)了決定粉果果皮顏色的關(guān)鍵變異位點(diǎn),此位點(diǎn)的變異使得成熟的粉果番茄果皮中不能積累類黃酮。這一發(fā)現(xiàn)為培育粉果番茄品種提供了有效的分子育種工具。
在番茄商品化育種中,由于強(qiáng)調(diào)追求高產(chǎn)和耐儲(chǔ)運(yùn)等,番茄風(fēng)味品質(zhì)下降了。在番茄變異組大數(shù)據(jù)的基礎(chǔ)上,黃三文團(tuán)隊(duì)正和美國(guó)科學(xué)院院士Harry Klee教授領(lǐng)導(dǎo)的團(tuán)隊(duì)緊密合作,將闡明影響番茄風(fēng)味的20多種揮發(fā)性物質(zhì)的代謝和積累的機(jī)理,為培育更加美味的番茄提供新的工具。
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