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    本報北京10月22日電 記者胡其峰、通訊員李海芬22日從中國農(nóng)科院獲悉，最新一期的國際權(quán)威學(xué)術(shù)期刊《自然―遺傳學(xué)》在線發(fā)表了該院蔬菜花卉研究所研究員黃三文領(lǐng)銜的國際黃瓜基因組研究團隊的研究論文。此次研究對115個黃瓜品系進(jìn)行了深度重測序，并構(gòu)建了包含360多萬個位點的全基因組遺傳變異圖譜。這是該團隊繼2009年完成黃瓜全基因組序列圖繪制后的又一重大成果，為全面了解黃瓜這一重要蔬菜作物的進(jìn)化及多樣性提供了新思路，并為全基因組設(shè)計育種打下了基礎(chǔ)。
    據(jù)介紹，黃瓜源自喜馬拉雅山脈南麓，本是印度境內(nèi)土生土長的植物。野生黃瓜果實和植株都比較矮小，果實極苦。經(jīng)過人類的馴化，黃瓜果實和葉片都變大了，果實也失去了苦味，成為品種多樣的可口蔬菜，如今在世界范圍內(nèi)廣泛種植。在科研上，黃瓜常被用來作為研究植物性別決定、維管束形成的重要模式系統(tǒng)。
    黃三文科研團隊通過對115個黃瓜品系重測序和1個野生黃瓜從頭測序，發(fā)現(xiàn)了多項關(guān)鍵數(shù)據(jù)，并構(gòu)建了1個單核苷酸分辨率的黃瓜遺傳變異圖譜。所挑選的115個黃瓜品系分為印度類群、歐亞類群、東亞類群和西雙版納類群等4大類，其中印度類群主要來自野生變種，而其余3個品種均來自栽培變種。通過比較分析發(fā)現(xiàn)，印度類群遺傳多樣性遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過其他3個類群。這一結(jié)果證實了印度是黃瓜的發(fā)源地，也意味著野生資源中尚有很多待挖掘的基因資源。
    科研團隊還對3種果蔬（黃瓜、西瓜和西紅柿）和3種谷物（大米、玉米和大豆）的馴化過程進(jìn)行了比較研究，結(jié)果發(fā)現(xiàn)在馴化過程中，果蔬比谷物的遺傳多樣性下降趨勢更大，這就解釋了為何經(jīng)馴化的黃瓜群體比谷物要小得多。研究人員推斷果蔬在進(jìn)化過程中的“瓶頸期”相對要更窄些。
    研究發(fā)現(xiàn)，黃瓜基因組中有100多個區(qū)域受到了馴化選擇，包含2000多個基因。其中7個區(qū)域包括控制葉片和果實大小的基因，果實失去苦味的關(guān)鍵基因已經(jīng)明確地定位在染色體5上包含67個基因的一個區(qū)域里，為下一步克隆這一重要蔬菜馴化基因打下了基礎(chǔ)。