人民網(wǎng)北京10月13日電 (記者 魏艷)在番茄商品化育種中,由于強(qiáng)調(diào)追求高產(chǎn)和耐儲(chǔ)運(yùn)等商業(yè)品質(zhì),番茄風(fēng)味品質(zhì)下降了,消費(fèi)者抱怨番茄的味道越來(lái)越淡了。近日,中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉所研究員、深圳農(nóng)業(yè)基因組所副所長(zhǎng)黃三文領(lǐng)導(dǎo)研究團(tuán)隊(duì),通過(guò)對(duì)世界各地的360份番茄種質(zhì)進(jìn)行了重測(cè)序分析,構(gòu)建了完整的番茄遺傳變異組圖譜,為培育更加美味的番茄提供新的工具。
番茄起源于南美洲的安第斯山脈,在隨后的幾百年中番茄被傳播到世界各地,如今已成為品種多樣、世界各地普遍種植的第一大蔬菜作物。據(jù)聯(lián)合國(guó)糧農(nóng)組織統(tǒng)計(jì),全球番茄的總產(chǎn)值為550億美元。在番茄變異組大數(shù)據(jù)的基礎(chǔ)上,黃三文團(tuán)隊(duì)正和美國(guó)科學(xué)院院士Harry Klee 教授領(lǐng)導(dǎo)的番茄品質(zhì)育種團(tuán)隊(duì)緊密合作,將闡明影響番茄風(fēng)味的20多種揮發(fā)性物質(zhì)的代謝和積累的機(jī)理,為培育更加美味的番茄提供新的工具。
此外,通過(guò)群體遺傳學(xué)分析,該研究還揭示了番茄果實(shí)變大經(jīng)歷了從醋栗番茄到櫻桃番茄再到大果栽培番茄的兩次進(jìn)化過(guò)程,在此過(guò)程中分別有5個(gè)和13個(gè)果實(shí)重量基因受到了人類(lèi)的定向選擇。
研究團(tuán)隊(duì)通過(guò)比較不同番茄群體的基因組差異,發(fā)現(xiàn)第5號(hào)染色體是決定鮮食番茄和加工番茄(主要用于生產(chǎn)番茄醬)差異的主要基因組區(qū)域,此區(qū)域含有多個(gè)控制番茄可溶性固形物和果實(shí)硬度的基因,這些基因賦予了加工番茄顯著的特征。此外,通過(guò)全基因組關(guān)聯(lián)分析,發(fā)現(xiàn)了決定粉果果皮顏色的關(guān)鍵變異位點(diǎn),此位點(diǎn)的變異導(dǎo)致SlMYB12基因啟動(dòng)子區(qū)域的缺失,進(jìn)而影響該基因的表達(dá),從而使得成熟的粉果番茄果皮中不能積累類(lèi)黃酮。我國(guó)北方消費(fèi)者偏好粉果番茄,這一發(fā)現(xiàn)為培育粉果番茄品種提供了有效的分子育種工具。
通過(guò)比較基因組學(xué),研究團(tuán)隊(duì)準(zhǔn)確地界定了野生番茄基因組片段在栽培番茄基因組中的位置和長(zhǎng)度。分析發(fā)現(xiàn),番茄的馴化和野生資源的利用共導(dǎo)致了約25%(約2億個(gè)堿基)的基因組區(qū)域被固定,這嚴(yán)重限制了番茄的進(jìn)一步改良。有了變異組提供的1100多萬(wàn)個(gè)分子標(biāo)記,今后育種有可能突破這一限制,進(jìn)一步拓展番茄育種的空間。
最新研究成果以長(zhǎng)篇幅論文在線(xiàn)發(fā)表于10月13日的《Nature Genetics(自然·遺傳學(xué))》雜志。該研究是繼2012年《Nature》發(fā)表番茄全基因組序列圖后取得的另一重要成果,也是中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉研究所功能基因組創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)近年來(lái)在《Nature》、《Nature Genetics》、《PNAS》、《PLoS Genetics》等刊物上發(fā)表多篇研究論文后,又一次在國(guó)際知名雜志發(fā)表的重要研究成果。蔬菜所所長(zhǎng)杜永臣認(rèn)為必須借助基因組學(xué)研究,努力提高我國(guó)蔬菜育種的核心競(jìng)爭(zhēng)力,促進(jìn)民族種業(yè)的跨越性發(fā)展。
本研究得到了國(guó)家“973”計(jì)劃、國(guó)家杰出青年科學(xué)基金、“863”計(jì)劃、農(nóng)業(yè)部和中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院科技創(chuàng)新工程等項(xiàng)目的資助。
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