本報訊（記者黃哲雯）中國農(nóng)科院作物科研所賈繼增研究員主導的研究團隊，在小麥D基因組測序研究中揭示了轉(zhuǎn)座子（TE）在小麥基因組中的重要功能，于近日完成了染色體級別的基因組精細圖譜的繪制，并首次獲得一個完整的組合圖譜。這一研究成果，將極大加速小麥重要基因克隆和分子育種研究。
小麥是世界上重要的農(nóng)作物之一，基因組巨大而且復雜，這使得小麥基因組測序組裝異常困難。粗山羊草是小麥D基因組供體種，對小麥品種改良非常重要。該研究團隊在2013年完成了粗山羊草基因組草圖的繪制工作，研究成果在《自然》上發(fā)表后，4年多來已被引用412次，成為小麥研究領(lǐng)域的高引論文之一。然而受當時技術(shù)條件的限制，影響了研究的深入與基因組信息的利用。
近年來，該團隊利用二代、三代等測序技術(shù)與最新的組裝技術(shù)，對D基因組重新測序與組裝，將組裝質(zhì)量提高210倍，完成了染色體級別的D基因組精細圖譜的繪制：利用高質(zhì)量的組裝結(jié)果，準確地進行了基因注釋，構(gòu)建了基因分布圖、基因表達圖、假基因分布圖、重復序列分布圖、甲基化分布圖、重組率分布圖和smallRNA分布圖。研究發(fā)現(xiàn)，粗山羊草基因組中有一批基因在近期發(fā)生了復制。研究還重點分析了轉(zhuǎn)座子對基因組結(jié)構(gòu)、基因復制、假基因形成與基因表達的影響，發(fā)現(xiàn)有近1/2的基因中攜帶有TE，是已測序基因組中攜帶TE基因最多的物種，也是迄今為止報道的假基因數(shù)量最多的物種。
