近日,中國農業科學院深圳農業基因組研究所發布了兩個高質量的檀香染色體水平基因組,揭示了檀香基因組的進化歷史,為檀香新品種的開發、改良和保護奠定了基礎。相關研究成果發表在《通訊生物(Communications Biology)》上。
檀香被稱之為“黃金之樹”,以其持久和獨特的香氣而聞名,有很高的經濟價值,然而,除印度檀香外,檀香目其他品種均未報道過染色體級的基因組,為了更好地研究、利用和保護檀香屬的寶貴資源,研究團隊利用HiFi測序和Hic組裝技術,成功獲得了兩個檀香高質量全基因組組裝序列,通過進化基因組分析,描述了檀香基因組進化歷史,發現檀香近期發生過一次全基因組復制事件,且為檀香科分支獨有,說明了檀香科物種在與蒜頭果分化后發生了適應性進化。研究人員通過比較基因組學分析,發現檀香基因組中轉座子含量與檀香目另一物種蒜頭果基因組中轉座子含量相差巨大,導致前者的基因組的大小僅為后者的六分之一。
該研究得到國家自然科學基金、中國農業科學院“青年英才計劃”等項目支持。(通訊員 馬昕怡)
原文鏈接:https://www.nature.com/articles/s42003-023-04980-2
檀香基因組(左)和斐濟檀香基因組(右)