“十一五”以來，我院基本建設工作落實“提升能力、謀劃未來，以科技創新支撐現代農業發展”的工作任務，以科技創新平臺建設為核心，以支撐科技創新能力提高為目標，堅持以研為本，科學謀劃，不斷提高基本建設管理水平，努力實現基本建設跨越式發展，取得了豐碩成果，為全院各項事業快速發展提供了有力支撐。
一、規劃管理制度日趨完善。強化規劃引領發展的工作思路，編制了《中國農業科學院基本建設規劃（2011-2020年）》、《中國農業科學院“十二五”基本建設規劃》、《中國農業科學院院部大院控制性詳細規劃》、《中國農業科學院馬連洼三所總體規劃》、《中國農業科學院南口基地總體規劃》。其中《中國農業科學院基本建設規劃（2011-2020年）》是全院第一部指導農業科研基礎條件建設的長期規劃，對院屬單位“十二五”期間科研平臺建設和重大項目申報具有重要指導意義。
制定了《中國農業科學院基本建設管理辦法（試行）》、《中國農業科學院綜合試驗基地建設項目管理辦法》、《中國農業科學院基本建設項目實施關鍵點控制圖》、《基本建設管理“八要八不”》、《中國農業科學院基本建設項目申報、驗收全過程示范文本（試行）》、《中國農業科學院設計、監理、施工總承包招標文件示范文本（試行）》等制度和規范，并編制了《基本建設管理文件選編》，促進了在建項目的規范化管理。
二、重大科研基礎設施快速推進。中國農作物基因資源與基因改良重大科學工程通過驗收；農產品質量標準與檢驗檢測中心、航天育種工程、研究生公寓完成建設；中國農業科學院圖書館擴建、國家農業生物安全科學中心、哈爾濱獸醫研究所綜合實驗室和蘭州獸醫研究所綜合實驗室正在加緊建設；國家畜禽改良研究中心正在設計。
三、所區建設和科研辦公環境明顯改善。上海獸醫所、煙草所、麻類所、棉花所通過集中建設，實現了新所區搬遷；哈獸研、特產所正在進行新所區建設；中關村院區和馬連洼院區完成了院部辦公樓、西大門、大院綠化改造工程、大院電力增容改造及外電源工程、大院地下管網基礎設施改造工程、舊辦公樓修繕、 馬連洼院區綜合改造、院部聯建住宅、馬連洼住宅等建設項目，面貌煥然一新。
四、試驗基地（臺站）建設有力。確立了“兩重點一適度”的試驗基地建設思路，即，重點推進綜合性試驗示范基地，重點推進滿足區域布局要求的試驗基地，適度支持一般性的專業基地。已建成廊坊、昌平南口、昌平馬池口等7個試驗基地以及呼倫貝爾、洛陽、德州、壽陽等9個野外科學觀測臺站，正在建設海南三亞、新疆阿克蘇、青海平安、河南新鄉等基地，云南大理、江蘇南京等基地正在設計中。
五、質檢體系極大完善。新建（改造）部級農產品質檢中心17個和區域農產品質檢中心1個，極大地完善了我院及我國的質檢體系，提升了農產品檢測能力。
六、在建項目執行進度明顯加快。建立全院在建項目月報、通報、約談制度，實行在建項目執行進度與新項目申報、年度投資申請掛鉤制度，建立在建項目例行檢查指導制度，全面推進在建項目建設進度。“十一五”期間全院下達國家投資較“十五”期間增長49.5%，建成科研用房27.7萬平方米，科研輔助用房8.5萬平方米，改造各類實驗用房（畜禽舍等）5.9萬平方米，溫網室4.2萬平方米，購置科研儀器設備 7897臺（套）。2008年全院在建項目由115個下降到86個，2009年由118個下降至70個，2010年由70個下降到59個。
為進一步明確“十二五”期間我院基本建設的發展目標，全面實現我院基本建設由生存型向發展型的歷史性轉變，為我院大幅、快速、可持續提升自主創新能力提供更加有力的物質支撐，組織制定了我院基本建設“十二五”期間的發展思路。
一、明確“一條主線”。緊緊圍繞我院“三個中心 一個基地”戰略目標，以支撐自主創新能力提升為核心，支撐九大學科群建設，大力推動重大科技設施和科技平臺建設，全面實現基本建設三項重要轉變，即基本建設從生存型向發展型轉變，基本建設管理由經驗式向科學化轉變，建設項目申報由自由滾動式向規劃引導式轉變。
二、牢記“兩個堅持”。一要堅持“以研為本”。以支持自主創新能力提升為核心，整體提升我院實驗室條件與設施裝備水平，重點建設5個具有國際一流實驗條件與設施裝備的綜合性研究平臺，實現我院“九大學科群”創新基礎設施的整體提升；堅持農業主產區、生態區導向，重點建設12個規模效益明顯、地域布局急需、專業功能突出的試驗基地，基本實現我院試驗基地戰略布局和體系化建設；加快完善院所基礎設施，重點打造3-5個基礎設施條件在國內外有較強示范性的現代科研院所。二要堅持“以人為本”。推進基本建設管理人才隊伍建設，通過引進、培養、交流等方式，構建一支50人左右的骨干隊伍，在全院范圍內統籌使用；遴選8個左右基本建設項目作為管理示范工程，通過示范工程管理培養人才、積累經驗；從規劃設計與建設管理兩個層面推進院所建設，構建和諧、宜居環境。
三、抓好“兩優一快”工程。優先加強重大科技平臺基礎設施建設，優先加強綜合試驗基地、地域布局型試驗基地建設，快速推進現代科研院所基礎設施建設進程。通過實施“兩優一快”工程，實現重點學科領域、優勢學科領域創新基礎設施的顯著提升，基本完成我院試驗基地布局和體系化建設，大幅改善科研院所基礎設施條件，使我院科研基礎條件支撐體系與綜合保障能力實現跨越式發展，為推進“三個中心一個基地”建設邁上更高層次提供堅強有力的物質保障，具體任務如下：
——重大科技平臺基礎設施建設任務。重點推進國家生物安全科學中心、國家畜禽改良研究中心、哈爾濱獸醫研究所綜合實驗室、蘭州獸醫研究所綜合實驗室、中國農業科學院圖書館等項目的建設；推進國家作物種質資源庫等項目的籌劃和立項。依靠重大項目的籌劃與建設，使我院重大項目投資所占比例大幅上升，科技平臺支撐能力顯著增強。
——試驗基地布局與建設任務。重點新建3個能夠進行多學科、大規模試驗的國家級綜合試驗示范基地，黃淮海國家農業綜合試驗示范基地（新鄉）、華南現代農業綜合示范基地（深圳）、東北平原國家農業綜合試驗示范基地（黑龍江墾區、吉林），2個能夠解決我院地域布局型基地（南繁、北繁）和7個專業功能突出的試驗基地（現代農業、云南、江西、茶葉、煙草、農機、特產）；依靠試驗基地布局結構的調整與建設，實現我院農業科研、野外觀測、示范推廣等科技創新鏈條的縱向、橫向一體化，在基地規模總量上再上一個新臺階。
——現代科研院所基礎設施建設任務。以全面增強科研院所的可持續發展能力為目標，重點打造3-5個基礎設施在國內外有較強示范性的現代科研院所，兼顧院所均衡發展，基本解決我院部分研究所實驗室條件和設施裝備差，業務用房不達標，院所區基礎設施老化、不配套等問題，逐步完善院所信息化，整體推進創新設施精良、配套設施完善、支撐體系完整的現代化科研院所基礎設施建設。
——基本建設管理能力建設任務。繼續在隊伍建設、示范工程、管理創新和制度建設四個方面著力，力爭“十二五”末，在全院打造一支50人左右規模的基本建設管理骨干隊伍；“十二五”期間打造8個左右的示范工程，力爭每個片區都有一個示范工程，院本級項目全部納入示范工程；進一步鞏固和深化“規范管理年”活動成果，加強片區互助管理和全院人才統籌使用機制的探索與完善，加強工程質量和進度管理創新，探索質量溯源方式和跟蹤管理方式，進一步完善基本建設制度，加強制度的宣傳和貫徹；加強基建檔案的管理。
