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本發(fā)明公開了一種利用CRISPR-Cas9系統(tǒng)敲除甘藍型油菜BnMAX1基因的方法及應用，設計了兩種特異性靶向甘藍型油菜BnMAX1基因的sgRNA并制成oligo二聚體，與Cas9載體連接，通過農桿菌介導的遺傳轉化技術導入到甘藍型油菜下胚軸愈傷并再生成苗，Cas9核酸酶在sgRNA的引導下，剪切目標序列，每條sgRNA都能通過CRISPR-Cas9系統(tǒng)介導A和C基因組上BnMAX1基因的剪切，達到基因敲除的目的。經過表型鑒定，發(fā)現(xiàn)純合突變株系增加了分枝數(shù)、單株角果數(shù)，降低植株高度，同時也增加了產量。